莲师知道以后魔化身的藏王之侄子将会毁灭佛法，乃赐予藏王许多未来的授记与指示。并且与福田施主们相商议，为令密咒乘之教法不没落，不被世智辩聪者所伪造败坏，为使加持力不退失，并且为未来弟子依序出世于此世等缘故，乃将国王的百个师传伏藏，五个伟大的心意伏藏，二十五个深奥的伏藏，以此等为主的无数有名称或无名称的伏藏皆埋藏之。而对于取藏时间，有缘取藏之人，具福缘之执持法教者等等，也都一一加以授记。莲师又在"门卡涅宁星给"堡等十三处称为虎穴的地方，现出极忿怒可怕的身相，将藏地所有大小神鬼傲慢者悉皆调伏，令发誓言守约，并且委派他们作为伏藏之守护神。此时莲师称为"忿怒金刚"(多杰左勒)。又为令后代起信故，在"崩唐多杰借巴"等诸地留下身形之影，在"南措秋摩"等地留下手印，在"巴左扎嘎"等地留下脚印，至于其他所有的修行圣地，也都留有莲师父母无数极稀有的手脚等印痕的展现。

如果说莲师住藏是一百一十一年，仅取其一半来计算：在藏王赤松德真二十一岁时，莲师入藏。藏王死于六十九岁，此后莲师应该又住留若干年后才前往罗刹国去。因为全长是五十五年又六个月，而赤松王在位时，莲师已住藏四十八年，所以很明显的，在藏王死后莲师又住了七年零六个月。

有一次国王向莲师请求赐予金刚乘的戍熟(灌顶)与解脱(讲解)，莲师乃于"桑耶亲普"寺中，启建八大法行之坛城，令王臣等九人获得成熟，并且又各别地传授教法以及守护管理其教法的任务指示，而此九人亦皆各获得合其种姓的成就。(译者按：例如移喜措嘉接受普巴，并应当延续维护此教法，不令坏失…等等)

文殊菩萨化身的法王"赤松德真"在他二十岁时，涌现了要将正法大力弘扬开来的希望，即由印度迎请亲教师"菩提萨埵"前来教授缘起与十善之法要。在二十一岁建庙铺基时，西藏神鬼们就来阻扰中断，不许建造。藏王依亲教师的指示预言，乃派遣"贝千"等五人为迎请大阿阇黎(莲师)的使者。而阿阇黎亦知其时机已至，即由尼泊尔取道，辗转入藏。初由"芒"地一直到"阿里"、"卫藏"、"朵康"等西藏诸地，悉运其神变的展现，以莲足履踏之，将十二地母、十三歌神、二十一位居士等为首的大力非人，悉皆调伏，令其等循守誓约并接收其等的心命。莲师在"红岩槛柳园"中与藏王见面晤谈，并在到达"黑波山"后，将该地一切神鬼悉摄入其教诫之下。而在打好"桑耶"寺之地基开始建寺时，一切神鬼亦皆变成顺朋助友，而在五年内，建筑出具备须弥山、四大洲、八小洲、日、月、铁围山等规模的寺院，全名为"巴桑耶敏久伦记珠贝助拉康"(吉祥无限且不变的自然天成寺)，并且完成三位后妃的三座寺庙。当在举行开光请住世仪式时，有五种极殊胜的加持征兆出现。